Wizard City, una città che accoglie chiunque ma che non dà il benvenuto a nessuno... Una fata di nome Fran viene condotta a forza in uno dei più pericolosi locali della città, Neverland, dove un ninja smarrito di nome Koyukimaru è stato fatto prigioniero da malviventi che vogliono ottenere informazioni sulla "Pergamena delle Calamità". I due dovranno combattere contro le tenebre che si stanno diffondendo per tutta la città.