Shinichi Kudo è un brillante liceale appassionato di gialli e, nonostante la giovane età, collabora con la polizia nelle indagini e riesce a risolvere da solo anche i casi più complicati. Un giorno, mentre è al parco divertimenti con la sua amica d'infanzia Ran, nota qualcosa di sospetto, ma prima che possa agire gli viene somministrato da dei loschi uomini in nero uno strano farmaco che... lo fa tornare bambino. Chi sono e cosa nascondono quei misteriosi criminali che lo hanno fatto rimpicciolire? E, soprattutto, come farà a ritornare quello di prima? Ecco un caso davvero difficile per Shinichi, che questa volta però dovrà affrontare sotto le mentite spoglie del "piccolo detective" Conan Edogawa. Il detective Mori viene invitato in un programma televisivo di argomento poliziesco, ma proprio mentre va in onda lo show, nello stesso edificio avviene un omicidio. Sarà poi la volta di far luce sul misterioso appuntamento di Ran con una persona che lei stessa definisce "molto importante". In questo caso, però, a muovere l'irrefrenabile curiosità del piccolo detective è anche una punta di gelosia...