Shinichi Kudo è un brillante liceale abilissimo nel risolvere qualunque enigma o caso di omicidio, anche il più complesso. Un giorno viene catturato da dei misteriosi uomini in nero e viene costretto a bere una strana medicina che lo trasforma in un bambino delle elementari. Da quel momento diverrà Conan, il piccolo detective più famoso del Giappone! Kaito Kid, il più abile ladro esistente, si troverà di fronte al sistema antifurto migliore del mondo. Riuscirà ad averla vinta anche questa volta, o Conan e la polizia lo acciufferanno una volta per tutte?