Mayuri è venuta accidentalmente a conoscenza della verità sulla morte di Kurisu, che ha sacrificato la propria esistenza per salvarla. Quindi la ragazza decide di tornare nel passato insieme a Suzuha per rivelare a Okabe... o meglio, a Kyoma Hooin, i propri sentimenti. Sta così per iniziare l'Operazione Arclight, quando...