Leon, soldato d'élite di un'Europa militarista, viene imbarcato con la forza per una spedizione segreta. In un Giappone in rovina, abbandonato da più di due secoli, lui e i suoi compagni di sventura dovranno recuperare un'arma misteriosa dal nome in codice Tsugumi. Un congegno spaventoso, dal potenziale distruttivo tale che il mondo ha preferito schiacciare l'arcipelago Giapponese sotto una pioggia di bombe atomiche piuttosto che vederne completato lo sviluppo. Lo sbarco però fallisce e Leon si ritrova a solo nella baia di Tokyo. Affamato, allo stremo delle sue forze e con una sola tuta anti-radiazioni per proteggersi, scopre subito che la città non è deserta come previsto...